Program studi pascasarjana dalam Teknik Geodesi dan Geomatika merupakan kelanjutan linier dari program sarjana. Program ini mengarah ke gelar akademik Magister Teknik – MT. S
Program pascasarjana ini juga membuka peluang bagi pemegang gelar dalam teknik geodesi dan geomatika untuk melaksanakan pendidikan profesi dalam hidrografi.